西南林学院环境科学与工程系成立于2001年，目前有水土保持与荒漠化防治、环境科学、环境工程和农业资源与环境四个本科专业，生态学、水土保持与荒漠化2个硕士学位授予点。有水土保持、环境科学和环境工程三个教研室，设环境科学、环境规划和水土保持三个实验室，分别下设多个实验分室。拥有水土保持方案编制乙级资格证书、水土保持监测甲级资格证书。

    目前我系教师人数53人。从学历看，已获得博士学位的16人，博士所占比例为30.2%，获得硕士学位的31人，硕士所占比例为58.5%，有云南省学术与技术带头人1人；从职称看，我系共有教授7人，占13.2%，副教授18人，占34%。

    我系以环境科学作为重点建设学科，下设退化生态系统的水土保持生态修复理论与技术研究、环境监测与管理、非点源污染控制、森林生态系统四个重点研究方向。为西南地区生态环境建设、建设新农村环境综合整治以及开发建设过程中的生态恢复开展科学研究、培养专业技术人才和提供科技服务。

    建系后，我系不断加强学科建设、科学研究和对外业务联系，使我系的整体学术水平、科研能力和对外科技服务能力有了较大的提高，先后与清华大学合作共建环境科学省院省校教育合作共建、咨询重点学科，与云南农业大学共建云南省环境科学与工程创新人才培养基地，负责建设教育部“水土保持与荒漠化”特色专业、云南省“水土保持与荒漠化”重点专业和云南省精品课程“水土保持学”。负责承担了国家科技攻关项目（95-007-02-03）、国家自然科学基金项目（30170779和30660037）、省科技攻关项目（2006SG20）、省自然科学基金重点项目（2001D0008Z）和面上项目等科研项目20余项。完成和正在实施“云南迪麻洛河水电站工程水土保持方案编制”等多项开发建设项目水土保持方案编制，完成和正在实施“昆石高速公路建设工程水土保持监测”、“昆畹高速公路建设工程水土保持监测”、“云南长江上游生态修复香格里拉试点县生态修复效益监测”、“玉溪市尖山河小流域生态修复水土保持监测”、“云南长江上游生态修复姚安试点县生态修复效益监测”、“金安桥水电站工程水土保持监测”、“大理漾洱电站水土保持监测”等多项小流域综合治理水土保持监测、开发建设项目水土保持监测等横向科技服务项目。主持项目累计经费达800万元。近年获国家林业局科技进步二等奖1项，科技进步三等奖2项，云南省科技进步云南省科技进步二等奖1项，云南省科技进步三等奖3项。发表学术论文近百余篇，出版专著和教材5部。